بينما تم تصميم باقات رخصة IFZA الأولية لتكون شاملة، يجب أن تكون الشركات على دراية بالتكاليف الإضافية المحتملة التي قد تنشأ بعد رسوم التأسيس الأساسية. يمكن أن تشمل هذه المصاريف المتعلقة بمعالجة التأشيرات، مثل الفحوصات الطبية ورسوم طلب بطاقة الهوية الإماراتية، وهي قياسية لجميع تأشيرات الإقامة في الإمارات العربية المتحدة. على الرغم من أن الباقات تتضمن
مخصصات التأشيرات، فإن رسوم المعالجة الفعلية لكل طالب تأشيرة منفصلة ويتم تأكيدها في العرض الرسمي. علاوة على ذلك، إذا كان النشاط التجاري يتطلب موافقات محددة من هيئات تنظيمية خارجية في الإمارات العربية المتحدة، فقد يتم تطبيق رسوم حكومية إضافية. على سبيل المثال، قد تتطلب بعض الخدمات المهنية أو الأنشطة مثل تلك المتعلقة بـ
مركز نشاط software-development تصاريح من الوزارات أو الإدارات ذات الصلة. بينما تسهل IFZA هذه العمليات، فإن رسوم الأطراف الثالثة المرتبطة بها تتحملها الشركة عادةً. اعتبار آخر هو نوع المساحة المكتبية. بينما غالبًا ما يتم تضمين المكاتب الافتراضية، قد تختار بعض الشركات حلول المكاتب الفعلية — المكاتب المرنة، أو المكاتب المخصصة، أو المستودعات — والتي ستتضمن تكاليف إيجار إضافية. تختلف هذه التكاليف بشكل كبير بناءً على الحجم، والموقع داخل المنطقة الحرة، والمرافق المقدمة. من الحكمة أيضًا أخذ رسوم قانونية أو استشارية محتملة في الاعتبار إذا تم طلب خبرة خارجية لهياكل الأعمال المعقدة أو متطلبات امتثال محددة. لذلك، بينما تكون تكلفة رخصة IFZA الأساسية شفافة، يجب أن تأخذ الخطة المالية الشاملة في الاعتبار هذه المصاريف المتغيرة لتجنب المفاجآت.